目前，适合机械收获的根茎类中药材主要有黄芪、甘草、黄芩、当归、柴胡等。此类根茎类中药材均可采用振动筛和升运链式机械收获，技术较为成熟。党参由于根茎较脆、易断根，适应的专用收获机械相对较少。大黄由于根部较大，挖掘深度较深，动力消耗大，种植不够规范等原因，适应收获的专用机械也较少，需进一步改进。但所有根茎类中药材均可采用农用小型履带式挖掘机进行收获。根茎类中药材机械收获注意事项主要有以下四个方面：
一、收获机械的选用
根茎类中药材收获机械的选用需综合考虑以下因素：1.要根据拖拉机选配。马力大的拖拉机，选配收获机的工作幅宽越大:2. 要根据所种中药材的种植带宽度选配，尽量保证收获机工作幅宽与种植带宽度一致;3.要根据收获机可实现的最大挖掘深度选配，确保收获机能将中药材的根茎完全收获:4.要根据所收获中药材的品性选配，确保机械收获时不伤根、不断根，保证中药材的品质和品相。
二、收获前准备工作
1.开展根茎类中药材机械收获前需进行药材秧蔓和残膜清理作业，以减少收获过程中对机具部件的缠绕，影响正常作业。割秧一般在收获前周内进行，可采用人工割秧或机械割秧， 要求留茬高度在5厘米以下。残膜回收与割秧作业同步进行，可采用残膜回收机械进行清理回收。
2.开始作业前要保持机具良好工作状态，预防和减少作业故障，提高作业质量和效率。作业季节开始前要依据产品使用说明书对联合收割机进行一次全面检查与保养，确保机具在整个收获期能正常工作。正式开始作业前要选择有代表性的地块进行试收，试收过程中，要注意观察、倾听机器工作状况，发现异常时及时解决。
三、机组作业时需注意
驾驶根茎类中药材收获机械作业时，应注意: 1.控制好速度，一般采用二挡或三档作业，作业速度8-10 千米/小时，拖拉机发动机转速在1500-- 2000转/分;2.保持直线行驶，始终保持收获机中心线与前进方向中心线一致;3.严禁带负荷转弯调头。调头转弯时，须在直线行驶的前提下，先提升机具，再转弯调头;4.尽量使用力调节液压手柄操作，机组处于工作状态时，液压手柄在力调节位置，保持主机和机具之间有浮动，上下浮动3厘米以上;5.在挂接时保持左右水平，主机与机具前进方向中心线统一，左右浮动2一6厘米;6.及时清理杂物;7.适当增加配重，保持机组作业的稳定性。
四、机械收获的相关要求
1.对拖拉机的要求
根茎类中药材收获机械由于动力消耗较大，一般需要60马力以上的大马力拖拉机作为动力，以满足根茎类中药材的收获深度需要。另外，如条件允许，可选择带强压入土和加装爬行档的拖拉机，以满足丘陵山区药材收获需要。
2.对驾驶员的要求
驾驶中药材收获机组作业的操作人员除需熟练掌握拖拉机驾驶技能，取得拖拉机驾驶证外，还需熟练掌握收获机械性能，动收获机械操作规程，会挂接和调整，会传动轴的动力切断和接合，能够正确排除应用故障。
3.对辅助工作人员的要求
除驾驶人员外，每台根茎类中药材收获机械作业时，还需要配备4-6人开展收后中药材的辅助捡拾和装车运输作业。要求辅助人员必须注意安全，手脚麻利，听从指挥，一般在距离机组1米外的距离进行辅助作业，防止被机械损伤。